Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA2Q9UL42 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms