Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN8Q9UBY8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms