Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPASTQ9UBP0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms