Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC6Q9UBN7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms