Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAE1Q9UBE0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAE1Q9UBE0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAE1Q9UBE0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SAE1Q9UBE0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAE1Q9UBE0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAE1Q9UBE0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAE1Q9UBE0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAE1Q9UBE0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAE1Q9UBE0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAE1Q9UBE0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAE1Q9UBE0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAE1Q9UBE0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAE1Q9UBE0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAE1Q9UBE0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAE1Q9UBE0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAE1Q9UBE0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms