Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms