Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
SCHIP1Q9P0W5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCHIP1Q9P0W5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCHIP1Q9P0W5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCHIP1Q9P0W5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCHIP1Q9P0W5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCHIP1Q9P0W5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCHIP1Q9P0W5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms