Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DLL3Q9NYJ7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DLL3Q9NYJ7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms