Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms