Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM28Q9NW13 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM28Q9NW13 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms