Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms