Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms