Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPRMQ9NS64 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRMQ9NS64 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms