Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms