Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TOPORSQ9NS56 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms