Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO4Q9NRQ5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms