Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TSHZ2Q9NRE2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSHZ2Q9NRE2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms