Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BATF3Q9NR55 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BATF3Q9NR55 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms