Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf4Q9NR00 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf4Q9NR00 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms