Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31BQ9NQW1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC31BQ9NQW1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms