Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ94

A1CF, APOBEC1 complementation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1CFQ9NQ94 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A1CFQ9NQ94 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms