Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A4GALTQ9NPC4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms