Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSU72Q9NP77 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSU72Q9NP77 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms