Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms