Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC17Q9NP64 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms