Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms