Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZV7

HAPLN2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN2Q9GZV7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN2Q9GZV7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms