Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM4Q9C037 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms