Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP1Q9C000 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms