Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPF3BQ9BZI7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF3BQ9BZI7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF3BQ9BZI7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF3BQ9BZI7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF3BQ9BZI7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF3BQ9BZI7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF3BQ9BZI7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF3BQ9BZI7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF3BQ9BZI7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF3BQ9BZI7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPF3BQ9BZI7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF3BQ9BZI7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPF3BQ9BZI7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms