Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms