Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC8Q9BY41 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC8Q9BY41 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms