Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPO3Q9BXY4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms