Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
REPIN1Q9BWE0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
REPIN1Q9BWE0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms