Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLR3CQ9BUI4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3CQ9BUI4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms