Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAGR1Q9BTK6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms