Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms