Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOL4Q9BPW4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms