Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF5Q99942 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms