Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms