Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms