Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms