Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAMP1Q96JM3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms