Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTHRC1Q96CG8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms