Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC1Q96C34 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms