Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms