Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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GTF3C6Q969F1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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GTF3C6Q969F1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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GTF3C6Q969F1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C6Q969F1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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GTF3C6Q969F1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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GTF3C6Q969F1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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GTF3C6Q969F1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C6Q969F1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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