Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF3Q92576 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms