Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms