Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCAF4Q8WV16 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF4Q8WV16 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms